PENYULUHAN PENYAKIT GENETIKA SERTA CARA PENCEGAHANNYA DI KELURAHAN DURI KEPA JAKARTA BARAT

Analisis sekuens gen yang belum teridentifikasikan dapat dilakukan dengan metoda kajian bioinformatika, dengan metoda analisis multiple alignment dan filogenic tree dari beberapa spesies kekerabatan terdekat. Gen HIF-1α pada hewan cecak (Hemidactylus Platyurus) belum teridentifikasi dan belum diteliti sebelumnya. Untuk penelitian analisis peranan gen HIF-1α pada regenerasi ekor cecak perlu dilakukan pemetaan sekuens gen tersebut untuk keperluan analisis ekspresi gen dengan metoda elektroforosis atau RT-PCR. Maka kita perlu desain primer gen tersebut terlebih dahulu. Kekerabatan cecak secara filogenetik lebih dekat dengan Gecko Japonicus, dibandingkan hewan reptile lainnya yang sama-sama telah dianalisis sekuens gen HIF-1αnya. Oleh karena itu digunakan sekuens gen HIF-1α dari Gecko Japonicus dengan metoda multiple alignment dengan menggunakan software Mega7. Dari hasil multiple alignment tersebut diperoleh basa-basa DNA yang homolog dan dipilih sekuens basa DNA yang unik. Pemilihan basa DNA dari sekuen cds, memungkinkan yang terpilih adalah daerah ekson sebagai domain ekspresi gen. Hasil filogenetika gen HIF-1α pada hasil alignment menunjukkan kekerabatan yang cukup dekat antara gen HIF-1α dengan gen HIF-1α dari spesies lain sebesar 0,13. Hasil desain primer dengan menggunakan primer3 dan perlprimer diperoleh F-GAACCTCCCATGACATGCTT dan RCAGGGCGTGGTAGTATTCGT dengan panjang produk PCR 165 bp. Hasil elektroforesis dari jaringan ekor cecak yang beregenerasi dengan menggunakan hasil desain primer gen HIF-1α, menunjukkan adanya pita basa DNA pada panjang basa 165 bp dan hasil RT-PCR menunjukkan puncak pic sebesar 100 di suhu m 59 0 C. Hal ini menunjukkan adanya ekspresi gen tersebut dengan desain primer DNA gen HIF-1α dengan metoda multiple alignment dan filogenetik dari spesies kekerabatan terdekat.

1.  UEU-Research-10118-16_0183.pdf - 905 KB